Comparación de la prueba tridimensional con PCR múltiple, para detección de carbapenemasas / Comparison of tridimensional test with multiplex PCR for detecction of carbapenemases

Objetivo: Comparar la prueba fenotípica para la detección de carbapenemasas (Prueba Tridimensional -THT), con la prueba de biología molecular, reacción de polimerasa en cadena (PCR múltiple), para la detección de genes de resistencia. Materiales y métodos: De un total de 118 aislamientos de cepas de bacterias Gram negativas, del programa de vigilancia de multirresistencia en un hospital de tercer nivel, fueron evaluadas para la detección de carbapenemasas por Test de Hodge tridimensional (THT) y PCR Múltiple. Se hicieron cálculos de sensibilidad, especificidad, VPP, VPN, índice de validez e índice de Youden (IY), con sus intervalos de confianza. Resultados: Se observó que la prueba THT en comparación con PCR, presentó una sensibilidad de 98,41% (IC 95% 94,53 - 100), la especificidad fue de 83,64% (IC 95% 72,95 - 94,32) y los valores predictivos positivo y negativo fueron respectivamente 87,32 (IC 95% 78,88 - 95,77) y 97,87 (IC 95% 92,68 - 100). El índice de Youden fue 0,82 (IC 95% 0,72 - 0,92) y el índice de validez 91,53% (IC 95% 86,08 - 96,97) Conclusión: La prueba tridimensional de Hodge (THT), para detección de resistencia a carbapenémicos, puede ser una prueba de rutina útil en el laboratorio para sugerir resistencia por carbapenemasas

Objective: To compare the phenotypic test for detection of carbapenemases (Three-dimensional Test - THT), with molecular biology test (Multiplex PCR), for the detection of resistance genes. Methods: A total of 118 isolates of Gram-negative bacteria strains from the multiresistant surveillance program at a third-level hospital were evaluated for the detection of carbapenemases by three-dimensional test (THT) and the molecular biology PCR Multiple method . We calculated sensitivity, specificity, PPV, NPV, validity index and Youden index (IY), with their confidence intervals. Results: THT test compared to the multiple PCR test had a sensitivity of 98.41% (95% CI 94.53 - 100), specificity was 83.64% (95% CI 72.95 - 94 , 32) and positive and negative predictive values were respectively 87.32 (95% CI 78.88 - 95.77) and 97.87 (95% CI 92.68 - 100). Conclusion: The Hodge three-dimensional test (THT), for detection of carbapenem resistance, may be a useful routine laboratory test to suggest resistance by carbapenemases.

Comparación de los métodos de cuantificación de carga viral de VIH: COBAS® AmpliPrep/COBAS® TaqMan HIV-1 test, v 2.0, y VERSANT HIV-1 RNA 1. 0 Assay (kPCR) / Comparison of COBAS® AmpliPrep/COBAS® TaqMan HIV-1 test, v 2.0 and VERSANT HIV-1 RNA 1. 0 (kPCR) assays for HIV-1 plasma viral load

Objetivo. El propósito del estudio fue evaluar el desempeño del método VERSANTHIV-1RNA 1.0 Assay® (kPCR) (Siemens), para la cuantificación de la carga viral en pacientes con VIH-1, en comparación con el método COBAS® AmpliPrep/COBAS TaqMan HIV-1 test®, v2.0 (Roche Diagnostics) (CAP/CTM). Métodos. Las muestras fueron tomadas en dos tubos con EDTA, de 60 pacientes remitidos por el médico tratante para pruebas de carga viral como parte de su control de rutina de VIH/sida, y fueron procesadas para la cuantificación del ARN del VIH-1 por ambas técnicas. Se hizo análisis de regresión y se calcularon los coeficientes de correlación de Pearson, y los de correlación y concordancia de Lin. Se evalúo la concordancia entre las dos técnicas mediante el método de Bland-Altman. Resultados. El promedio de la carga viral por el método CAP/CTM fue 3,2±1,4 long10 copias/ml y, por el método kPCR, 3,0±1,3 long10 copias/ml. El 86,7 % de muestras presentó diferencias entre los dos métodos, menores de 0,5 long10 copias/ml, y el 13,3 % presentó diferencias mayores. El coeficiente de correlación de Pearson entre los dos métodos fue de 0,97 (IC95% 0,95-0,99) y el índice kappa ponderado entre los dos métodos en diferentes rangos de concentración, fue de 0,91 (IC95% 0,87-0,96). El promedio de las diferencias entre las mediciones fue 0,22 long10 copias/ml (IC95% -0,45 a 0,89). Conclusión. Las dos técnicas evaluadas fueron comparables, con el método kPCR se observaron resultados más bajos.

Objective: The purpose of this study was to evaluate the performance of the kPCR VERSANT (™) 440 HIV-1RNA 3.0 Assay® (Siemens) method for the quantification of viral load in HIV-1 patients, compared to the COBAS AmpliPrep/COBASTaqMan HIV-1 test®, v. 2.0 (Roche Diagnostics) (CAP/CTM). Methods: Samples were taken in 2 tubes with EDTA, in 60 patients referred by the attending physician for viral load tests as part of their routine control of HIV/AIDS, and were processed for quantification of HIV-1 RNA by both techniques. A regression analysis, the Pearson correlation coefficient and agreement of Lin were done. The agreement between the two techniques was evaluated with the Bland Altman analysis. Results: The mean viral load by CAP/CTM was 3.2 ± 1.4 long10 copies/ml and by kPCR it was 3.0±1.3 10 copies/ml. Most samples (86.7%) showed differences between the two methods lower than 0.5 long10 copies/ml, and 13.3% presented greater differences. The Pearson correlation coefficient between the two methods was 0.97 (95% CI 0.95-0.99) and the weighted kappa index between the two methods, in different ranges of concentration, was 0.91 (95% CI 0.87-0.96). The average difference between measurements by both techniques was 0.22 long10 copies/ml, (IC 95% -0.45-0.89). Conclusion: Both techniques were comparable, although lower values of viral load were observed with kPCR.

Infección y colonización faríngea asintomática de niños por Streptococcus pyogenes / Streptococcus pyogenes infection and asymptomatic throat carriage in children

Objetivo: establecer la frecuencia de estreptococo beta hemolítico del grupo A (Streptococcus pyogenes) en niños, mediante una prueba rápida de inmunoensayo cromatográfico. Métodos: estudio piloto de tipo transversal en una muestra no probabilística de 144 niños entre 3 y 13 años, asistentes a centros infantiles de Medellín y su área metropolitana y a una institución educativa de Bogotá. Se tomaron muestras de garganta por frotis para la prueba rápida de S. pyogenes y se recolectó información demográfica y de antecedentes personales mediante una encuesta. Se calcularon los promedios con sus desviaciones estándar y los porcentajes de acuerdo con la naturaleza de las variables de interés. Resultados: la edad promedio del grupo fue 5,5 ± 2,8 años con distribución similar por sexo. Veintiún niños (14,6%) fueron positivos para S. pyogenes, diez de ellos fueron posibles infecciones y 11, portadores asintomáticos. De los 144 niños, 45 (31,3%) tenían síntomas faríngeos, de los cuales 10 (22,2%) tenían S. pyogenes. Un total de 99 (68,8%) niños fueron asintomáticos y 11 de estos (11,1%) presentaron prueba positiva para S. pyogenes. Discusión: la alta frecuencia de S. pyogenes en este grupo es un llamado de atención sobre la necesidad de implementar protocolos de manejo con pruebas rápidas para la detección del microorganismo.

Objective: To establish the frecuency of Streptococcus pyogenes infection or asymptomatic carriage in a group of children, by means of a rapid antigendetection test. Methods: A cross-sectional study was carried out in a non-probabilistic sample of 144 children aged between 3 and 13 years, in two educational institutions in Bogotá and Medellin. A single throat specimen was obtained from each child to carry out the rapid test; demographic data and information on pertinent symptoms and signs were obtained by means of a survey. Mean and standard deviation and percentages were calculated according to the nature of the variables. Results: Average age was 5.5 ± 2.8 years, with even distribution by gender. Twenty one children (14,6%) were positive for S. pyogenes; out of them, 10 had possible infection and 11 were asymptomatic throat carriers. Forty five children (31.3%) reported pharyngeal symptoms and 10 (22.2%) out of them were positive in the rapid test. Ninety nine children (68.7%) were asymptomatic and of them 11 (11.1%) were also positive. Discussion: Management protocols for S. pyogenes infection would benefit from the detection based on rapid tests.

Hemoglobina glicosilada A1c vs. glucemia plasmática en ayunas de pacientes ambulatorios de un laboratorio médico / Glycosylated haemoglobin A1c compared to fasting plasma glucose in outpatients referred to a medical laboratory

Objetivo Comparar la prueba hemoglobina glicosilada (HbA1c) en diferentes puntos de corte, con la prueba de glucemia plasmática en ayunas (GPA); para medición de glucosa en sangre en pacientes ambulatorios de un laboratorio médico de la ciudad de Medellín, entre marzo y abril de 2010. Métodos Estudio en 1016 muestras de sangre de pacientes referidos a un laboratorio médico. Se obtuvo la concordancia entre las pruebas (Índice de Kappa), se calcularon sensibilidad y especificidad, además se evaluaron diferentes puntos de corte para la prueba HbA1c con la curva ROC. Se usó correlación de Spearman para establecer la asociación entre GPA y HbA1c. Resultados El valor promedio de HbA1c fue 5,7 % ±0,8 y de la GPA fue 96 mg/dL±26,1; y esta última fue mayor en hombres (99,04±32,7). El 75,4 % de las muestras fueron normales para diagnóstico de diabetes con la prueba GPA, y con la HbA1c el 51,4 % clasificaron en este rango. El punto de corte donde la combinación sensibilidad-especificidad presenta los mejores valores para HbA1c fue 6,2 %. Discusión La prueba HbA1c presentó valores altos de sensibilidad y especificidad, por lo que su uso rutinario en el diagnóstico de diabetes mellitus podría contribuir a la búsqueda activa y la detección precoz de casos, que aseguren un mejor control de los factores de riesgo.

Objective Comparing haemoglobin A glycosylate (HbA1c) at different cutoff points for blood glucose measurement to the fasting plasma glucose (FPG) test in outpatients visiting a medical laboratory in the city of Medellin between March and April 2010. Methods 1,016 blood samples were studied from patients who had been referred to a medical laboratory. Agreement was obtained between tests (Kappa index); sensitivity and specificity were calculated. Different cutoff points for the HbA1c test were also evaluated with the ROC curve. Spearman correlation was used to establish association between FPG and Hb A1c. Results Average HbA1c was 5.7 %±0.8 and average FPG was 96 mg/dL±26.1; this was higher in men (99.04±32.7). 75.4 % of the samples came within the normal range for diagnosing diabetes with the FPG test, compared to 51.4 % with the HbA1c test. The cutoff point where combined sensitivity and specificity presented the best HbA1c value in this study group was 6.2 %. Discussion The HbA1c test had high sensitivity and specificity values, so its routine use in diagnosing diabetes mellitus could contribute towards active and early detection of cases to ensure better control of risk factors.